Академия прошла в своем развитии несколько этапов:
НА ПЕРВОМ ЭТАПЕ (1991–1992 гг.) возникали секции, которые повторяли классическую предметную структуру естественных наук: Биомедицины, Математики, Наук о Земле, Физики, Химии;
НА ВТОРОМ ЭТАПЕ (1992–1993 гг.) в связи с возникновением новых приоритетных направлений исследований (социально значимых для обновляющегося и самоопределяющегося российского общества) появились и новые нетрадиционные секции: Геополитики и безопасности,Горно-металлургическая, Российских энциклопедий, Проблем макроэкономики и социального рыночного хозяйства, Проблем образования и поддержки молодых ученых, Экономики и социологии;
НА ТРЕТЬЕМ ЭТАПЕ (1993–1995 гг.) были организованы новые секции, отделения и научно-производственные центры. В их числе секции: Наук о лесе, Ноосферных знаний и технологий; региональные (Волго-Уральское, Кемеровское, Курское, Санкт-Петербургское, Томское и др.) и тематические отделения (Гуманитарных наук и творчества, Межотраслевыхэколого-экономических системных исследований, Нефти и газа, Ноосферного образования, Прикладной математики).
НА ЧЕТВЕРТОМ ЭТАПЕ (1995–2001 гг.) деятельность РАЕН приобрела широкий общероссийский характер, в ее составе было учреждено около ста региональных и тематических отделений. РАЕН принимала участие в организации ряда других академий, обществ, общественных движений и союзов.
Структурные подразделения Академии быстро адаптировались к изменениям условий организации науки и вносят сегодня существенный вклад в развитие фундаментальных и прикладных исследований и образования в России.
Академия через свои структуры – секции, отделения и центры – обеспечивает взаимодействие таких важнейших элементов жизни российского общества, как наука, практика, культура, образование и искусство.
Академия, объединяя значительную часть научного потенциала России, выступает инициатором создания различных ассоциаций, осуществляющих свою деятельность в русле общеакадемического движения. Под эгидой РАЕН активно работает Международная ассоциация авторов научных открытий и изобретений.
Ныне мы можем говорить о начале нового, ПЯТОГО, периода ее развития. Академия оформилась структурно, развила сеть региональных подразделений, определила восемь своих главных (ключевых) научных направлений исследований и творческих разработок:
- естественно-научное;
- научно-технологическое;
- социально-геополитическое;
- устойчивое развитие социума;
- социально-экономическое и проблем права;
- биология, медицина и экология;
- гуманитарные науки, образование и творчество;
- научные проблемы регионов.
В настоящее время продолжается системное развитие подразделений Академии, в том числе мобильных мультидисциплинарных структур – малых институтов, научных центров и региональных отделений, работающих над решением актуальных научных и практических задач.
Создание РАЕН явилось катализатором для образования в России еще более 70 общественных академий (Горной академии, Академииминерально-сырьевых ресурсов, Академии информационных процессов и технологий, Международной академии наук высшей школы, Международной академии авторов научных открытий и изобретений, Российской инженерной академии, Электротехнической академии и многих других), а также Международного союза общественных академий наук и Российского союза общественных академий наук.
Сегодня Российская академия естественных наук – одна из наиболее авторитетных организаций ученых, она характеризуется ростом и распространением своего влияния на всю территорию страны. Это общественное объединение сохраняет и развивает лучшие традиции российской научной и творческой интеллигенции.