В 1993 году по инициативе академика Е. П. Велихова, профессора А. К. Айламазяна и научных сотрудников ИПС РАН при поддержки ведущих предприятий и администрации города и района в Переславле--Залесском было создано первое в малом городе России высшее учебное заведение -- Университет города Переславля.
К середине 1990-х годов в городе и на его предприятиях, активно включившихся в рыночные преобразования, сформировалась потребность в специалистах в области высоких технологий, обладающих современными техническими навыками. Организация Университета полностью отвечала этим потребностям города.
В настоящее время "Университет города Переславля имени А. К. Айламазяна" играет важную роль в подготовке квалифицированных кадров для ИПС РАН и других предприятий Переславля, но главное -- он изменил лицо города. Патриархальный маленький городок становится городом студентов.
В 2002 г. Университет города Переславля прошел государственную аккредитацию и получил свое нынешнее название -- НОУ "Институт программных систем -- Университет города Переславля". Решением Попечительского Совета в 2003 году Университету было присвоено имя Альфреда Карловича Айламазяна.
Университет входит в состав научно-образовательного комплекса, создаваемого в Переславле по инициативе Института программных систем РАН.