В конце 90-х годов XX века возникла острая необходимость создать на базе колледжа филиал вуза. По инициативе директора колледжа физической культуры, Сазонова Юрия Ивановича и педагогического совета учебного заведения при поддержке ректора Уральской государственной академии физической культуры, Куликова Леонида Михайловича, в 2000 году было создано представительство УралГАФК. Директором назначен - кандидат педагогических наук, доцент Игорь Юрьевич Сазонов.
    За свою 15-летнюю историю филиал выпустил более 1300 специалистов по специальностям «Физическая культура и спорт» и «Адаптивная физическая культура», которые ценятся как в России, так и за рубежом, поскольку качество подготовки соответствует мировым стандартам. Некоторые из них занимают руководящие должности, работают в образовательных учреждениях различного уровня, спортивных клубах, центрах кинезотерапии, реабилитационных центрах, фитнес-индустрии. Учитывая потребности региона, Екатеринбургский институт физической культуры (филиал) ФГБОУ ВО «Уральский государственный университет физической культуры» открыл на своей базе направление в сфере подготовки кадров для туристической индустрии - «Туризм». Процесс обучения по данному направлению в Екатеринбургском институте физической культуры (филиал) ФГБОУ ВО «Уральский государственный университет физической культуры», выстроен таким образом, чтобы студенты, постигнув азы теории, тут же могли закрепить их на практике.
     Институт активно взаимодействует со школами, лицеями, колледжами, районными спорткомитетами Екатеринбурга и комитетами муниципальных образований Свердловской области, спортивными клубами и федерациями, общественными организациями и реабилитационными центрами в деле подготовки специалистов.
    Внеучебная жизнь института насыщена событиями разного масштаба. Традиционно в институте проводится рождественская акция «Подари улыбку детям», когда студенты-спортсмены выезжают к воспитанникам детских домов и устраивают им новогодний праздник. Проводит институт и традиционную спартакиаду для детей с ограниченными возможностями. Спортивно-педагогический отряд Екатеринбургского института физической культуры (филиал) ФГБОУ ВО «Уральский государственный университет физической культуры» участвует в физкультурно-оздоровительной деятельности в детских лагерях УрФО и на Черноморском побережье.
     У студентов института сложились свои традиции. Несколько поколений учащихся активно занимаются в университетской команде КВН «Фетисовы дети», неоднократно отмеченной призами многих конкурсов и фестивалей. В институте ежегодно проводятся мероприятия в честь Дня знаний и Дня Победы, а также осенний кросс памяти Ю.К. Кочкина, посвящение в студенты, слет отличников учебы, День учителя, фестиваль студенческих талантов, бал выпускников и многие другие. Студенты охотно участвуют в городских и районных акциях милосердия, в том числе, в днях донора и сборе благотворительной помощи для детского дома города Полевской.
     Большая работа проводится по пропаганде здорового образа жизни среди студенчества. Институт является постоянным организатором ежегодного проекта по профилактике табакокурения среди школьников города Екатеринбурга и Свердловской области «Соревнования классов свободных от курения», который проводится под патронажем Правительства Свердловской области и Екатеринбургской Епархии. 
     Не остается без внимания и патриотическое воспитание студентов. В институте хорошо развита система самоуправления, успешно работает институт кураторства. Большое значение отводится пропаганде здорового образа жизни, активно работает школа здоровья, где студенты и преподаватели могут заняться шейпингом, аэробной гимнастикой, плаванием, волейболом и другими видами спорта.

В 2003 году вручена Благодарность от Специального Олимпийского комитета Свердловской области «За большой вклад в развитие специального олимпийского движения в Свердловской области». 

В 2006 г. – Грамота Олимпийского комитета России.

В 2007 г. учебное заведение стало победителем конкурса «Ника», проводимого администрацией г. Екатеринбурга в номинации за достижения в Физической культуре и спорте. 

В 2007 г. Благодарность от Русской Православной церкви «За помощь в организации и проведении «Соревнований классов, свободных от курения»».

В 2009 и в 2011 году институт признан лауреатом конкурса Золотая медаль "Европейское качество" в номинации "100 лучших вузов России", а директор отмечен почетным знаком "Директор года".

В 2011 году институт награжден Почетным дипломом Губернатора Свердловской области "За большой вклад в подготовку высококвалифицированных специалистов, развитие и популяризацию физической культуры и спорта".

В 2013 году институт получил сертификат соответствия ассоциации по сертификации «Русский регистр», удостоверяющий, что система менеджмента качества соответствует требованиям ИСО 9001

В 2013 году вручено Благодарственное Письмо Губернатора Свердловской области "За создание условий для подготовки спортсменов высокого класса, показавших высокие спортивные результаты на XXVII Всемирной Универсиаде 2013 года в городе Казани".

В 2014 году вручена Благодарность от Специального Олимпийского комитета Свердловской области "За постоянную поддержку Специального Олимпийского движения в Свердловской области, содействие в реализации спортивных программ для людей с ограниченными возможностями здоровья".

В 2014 году вручено Благодарственное письмо волонтерскому отряду Екатеринбургского института физической культуры (филиал) ФГБОУ ВО «Уральский государственный университет физической культуры» "За большой вклад в развитие добровольческого движения в городе Екатеринбурге, реализацию спортивного проекта "Русский силомер".

Руководство института с гордостью оглядывается назад, ведь многие воспитанники удачно вошли в спортивный мир, а нынешние студенты упорно достигают поставленных целей. Екатеринбургский институт физической культуры (филиал) ФГБОУ ВО «Уральский государственный университет физической культуры» по праву может гордиться высочайшим уровнем профессорско-преподавательского состава и многочисленными достижениями своих выпускников.