Проект был поддержан Международным Образовательным Центром, Тверским комитетом муниципальной собственности, а также администрацией Тверского государственного технического университета.

Первоначально институт работал по грантовой программе Global Volunteers (США), предоставляя тверским предприятиям уникальную возможность прослушать мастер-классы и поучаствовать в тренингах американских специалистов высочайшего уровня.

В декабре 1996 года институт получил лицензию Министерства общего и профессионального образования Российской Федерации на ведение образовательной деятельности, тогда же был проведен первый набор студентов на направления «Экономика» и «Психология».

В 2001 году НОУ «Институт «Верхневолжье» получил свидетельство о государственной аккредитации по вышеуказанным направлениям.
За время своего существования институт участвовал в разнообразных российских и зарубежных программах. В 1999 году институт впервые выиграл грант по программе CDC (Citizens’ Democracy Corpse - программа поддержки малого и среднего бизнеса), финансируемой Государственным агентством США по международному развитию (USAID). Затем в 2001 г. грант был выигран повторно. За 4 года работы в программе институт наладил контакты как с американскими специалистами в различных сферах деятельности, так и с предприятиями и организациями города Твери и Тверской области, которые в дальнейшем перешли в тесные деловые и дружеские отношения. В рамках проекта были организованы поездки для студентов института, а также менеджеров среднего и высшего звена, в США с целью ознакомления с деятельностью крупнейших предприятий соответствующих отраслей. Всего по программе институт выполнил порядка 150 проектов, которые внесли большой вклад в развитие экономики Тверской области. При расформировании организации (CDC) и с целью развития региональных консалтинговых центров институту была передана бизнес-библиотека, которая значительно пополнила библиотечный фонд института и способствовала расширению кругозора студентов в области различных экономических дисциплин.

В результате пятилетнего сотрудничество с USAID в 1999 году при институте был создан Консалтинговый центр, наиболее крупным проектом которого является реализация проекта обустройства трассы Москва - Санкт-Петербург «Путь русского культурного наследия (ПРКН)». На протяжении последних трех лет институт активно работал над созданием и продвижением данного проекта, целью которого является восстановление 50 объектов исторического и культурного значения и развитие инфраструктуры вдоль трассы Москва - Санкт-Петербург. Особую значимость проекта «ПРКН» подтвердил профессор Калифорнийского и Нью-Йорского Университетов, консультант ЮНЕСКО, президент Американского общества охраны русских памятников культуры А.Р. Небольсин.

Группа студентов института «Верхневолжье» и Yale University (США) принимали активное участие в инвентаризации объектов историко-культурного значения вдоль трассы, а также в разработке маркетинговой стратегии проекта.

В 2002 г. был организован Американский Фонд «Путь русского культурного наследия», цель создания которого - продвижение проекта в США, организация начального финансирования проекта, привлечение инвестиций, работа с туроператорами. Члены Совета директоров Фонда, среди которых экс-губернатор штата Невада Боб Миллер, а также ряд видных бизнесменов США, неоднократно проводили мастер-классы и семинары для студентов вуза.

В апреле 2004 года институт совместно с «Горбачев-Фондом» организовал поездку в Лас-Вегас с целью развития научной базы проекта, а также ознакомления деловой общественности США с проектом. Презентация проекта была подготовлена сотрудниками и студентами института.

В рамках проекта ректор института Аксенова И.Н. провела ряд встреч, в частности с Патриархом Московским и Всея Руси Алексием II, с министром культуры РФ Соколовым А.С., которые одобрили идею проекта и выразили надежду на его скорейшее осуществление. Проект получил также поддержку Центрального Совета Президиума Всероссийского общества охраны памятников истории и культуры (ВООПИиК). Помимо этого в рамках работы по проекту состоялась встреча представителей института с Председателем Торгово-промышленной палаты США Эндрю Соммерсом. В результате встречи были достигнуты договоренности относительно сотрудничества по проекту.

Как результат работы рабочей группой института был создан бизнес-план по проекту.
Подготовлен документальный фильм, который широко используется в презентации проекта, одна из которых прошла в марте 2006 года в Австралии.

В августе 2000 года при институте был образован Центр маркетинговых исследований. Клиентами центра в разное время были такие компании как МТС-Тверь (сотовая связь), торговая компания АНТЭК, концерн «Евразия», московский аудиторский центр «ЦБА» и др.
В июне 2003 года институт выиграл грант по программе Европейского союза TACIS. Грант позволил институту провести программу обучения военнослужащих, уволенных в запас. В рамках программы, профориентацию и тестирование прошли 324 человека, 70% из которых были в дальнейшем трудоустроены.

На базе НОУ «Институт «Верхневолжье» был проведен ряд семинаров по модульным технологиям в образовании.
На протяжении четырех лет институт сотрудничает с Московским институтом бизнеса и делового администрирования при Академии народного хозяйства РФ. В январе 2002 года институт совместно с Московским институтом бизнеса и делового администрирования провел первую студенческую научно-практическую конференцию на тему «Менеджер XXI века», затем в марте 2003 года состоялась вторая конференция: «Формирование позитивного имиджа государства для привлечения инвестиций», в которой помимо докладов была проведена деловая игра. В апреле 2004 года прошла третья научно-практическая конференция «Маркетинг в современной России: проблемы и решения». По результатам всех трех конференций были опубликованы сборники тезисов докладов.

В мае 2003 года НОУ «Институт «Верхневолжье» открыл новые специальности – «Менеджмент организации» и «Юриспруденция».
За прошедшие 5 лет доходы от образовательной деятельности заметно возросли, что позволило институту расширить учебные площади, увеличить библиотечный фонд и обновить материальную базу, а также улучшить финансирование научной и воспитательной работы в вузе.
В июле 2003 года институт сменил адрес, переехав в большее по площади здание в центре города, которое является памятником архитектуры XVIII века. С этого же времени институт ведет ремонтно-реставрационные работы в соответствии с требованиями комитета охраны памятников Тверской области. В 2005 году институт провел полную реставрацию фасада здания.

Сейчас НОУ «Институт "Верхневолжье" хорошо известен в Тверском регионе и за его пределами своими образовательными и международными программами. Сотрудничая с зарубежными и отечественными учебными заведениями, используя их опыт и опираясь на собственный, институт разработал свою стратегию в области образования.

В 2001 году НОУ «Институт «Верхневолжье» вошел в число аккредитованных негосударственных вузов, пройдя аттестацию и получив государственную аккредитацию по двум направлениям – «Экономика» и «Психология».

НОУ «Институт «Верхневолжье» является членом Ассоциации негосударственных высших учебных заведений России. Ректор института входит в Совет ректоров вузов Тверской области.
С 2004 года ведутся переговоры об условиях вхождения НОУ «Институт «Верхневолжье» на ассоциативных началах в Университетский комплекс Тверского региона.