Начальная школа, классы коррекционно-развивающего обучения основной школы, девятые классы и классы старшей школы занимаются в первую смену, во II смену занимаются 6 классов. Свободные учебные помещения отданы на проведение воспитательной работы, кружковой, секционной, дополнительной учебной, научно-исследовательской работы.
Начальная школа работает в режиме пятидневной недели с продолжительностью урока в 35 минут и динамической паузой в 35 минут.
Основная и старшая школа – в режиме шестидневной рабочей недели с продолжительностью уроков в 40 минут.
Для детей с ограниченными возможностями здоровья организован особый, щадящий режим обучения, в том числе и обучение на дому.
Учебно-воспитательный процесс организован в соответствии со стандартами и нормативами, предписаниями СанПиН.
Реабилитационный кабинет задействован в соответствии с графиком проведения специальной коррекционно-развивающей, реабилитационно - оздоровительной работы.
МБОУ Школа №89 открыта в 1961 году. Учредитель школы КУМС при Администрации г. Уфы РБ. Здание школы типовое, общая площадь 3331, 8 м².
В школе имеется библиотека с фондом 24223 книги, столовая, мастерские, кабинет обслуживающего труда, медицинский, стоматологический кабинеты, два кабинета , два спортивных зала.
В 2004 году оборудован и оснащен специальными средствами реабилитационный кабинет для детей с ограниченными возможностями здоровья.
Техническое состояние школы удовлетворительное.