Государственное бюджетное образовательное учреждение города Москвы "Школа № 1421" создано в порядке реорганизации в форме слияния субъектом Российской Федерации - городом Москва, на основании приказа Департамента образовании города Москвы № 182 от 23 апреля 2013 года "О реорганизации государственных бюджетных образовательых учреждений Департамента образовании города Москвы, подведомственных Юго-Восточному окружному управлению образования города Москвы".
Государственное бюджетное образовательное учреждение города Москвы "Школа № 1421" является правопреемником Государственного бюджетного образовательного учреждения города Москвы центра образования № 1421 (Приказ Департамента образования города Москвы № 387 от 26 июня 2006 года "О создании Государственного образовательного учреждения центр образования № 1421").
Государственное образовательное учреждение города Москвы центр образования № 1421 реорганизовано приказом Департамента образования города Москвы № 850 от 5 сентября 2007 года путем присоединения Государственного образовательного учреждения детский сад № 2585